Kontrollsenteret til AutoStore fungerer som det sentrale kommandopunktet.
Det er ansvarlig for å spore plasseringen av kasser, roboter og porter, samt administrere trafikk og ruteplanlegging for oppgaver utført av roboter.
Samtidig håndterer programvareplattformen eManager fra Element Logic – skreddersydd for AutoStore – spesifikk produktinformasjon og aktivitet i kassene.